Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms