Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms