Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TTPAP49638 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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