Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms