Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms