Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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