Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP1P30622 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms