Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLD1P28340 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms