Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms