Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms