Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LMNB1P20700 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms