Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms