Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms