Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAV1P15498 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAV1P15498 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms