Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFTRP13569 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFTRP13569 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFTRP13569 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFTRP13569 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFTRP13569 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFTRP13569 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFTRP13569 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFTRP13569 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFTRP13569 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms