Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf47O95873 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms