Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms