Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F6O75461 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms