Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF3IP2O43734 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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