Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F3O00716 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms