Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms