Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms