Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms