Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms