Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms