Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms