Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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