Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4BQ9Y4P1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms