Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms