Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TPRKBQ9Y3C4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms