Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms