Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms