Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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