Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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