Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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