Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms