Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms