Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms