Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms