Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms