Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms