Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms