Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms