Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPBP1Q92547 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms