Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AVL9Q8NBF6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms