Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms