Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP4Q8N2S1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP4Q8N2S1 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms