Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms