Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms