Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLNKQ7Z7G1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLNKQ7Z7G1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms